1. Exenciones de  IVA: Este beneficio se otorga a Centros de investigación y desarrollo tecnológico reconocidos por COLCIENCIAS o a Instituciones de educación superior reconocidos por el Ministerio de Educación Nacional, los cuales en el marco de un proyectos de Ciencia, Tecnología e Innovación, se les otorga una exención en el impuesto IVA por la importación de equipos y elementos requeridos para el desarrollo de sus proyectos y que quedarán en poder de estas instituciones para el desarrollo de futuras investigaciones.
 
2. Ingreso no constitutivos de renta y ganancia ocasional: Se otorgan al personal que desarrolla actividades de Ciencia, Tecnología e Innovación dentro de un proyecto calificado bajos las condiciones del CNBT, permitiendo a los investigadores, descontar de los ingresos a declarar el valor de los honorarios recibidos por estas labores.