La ley 1530 de 2012 en su artículo 4 estableció que la Comisión Rectora del Sistema General de Regalías (SGR), es el órgano encargado de dictar, mediante acuerdos, las regulaciones de carácter administrativo orientadas a asegurar el adecuado funcionamiento del Sistema.
Por otra parte, el numeral 1 del artículo 5 de la Ley 1530 de 2012 señala que la Comisión Rectora es la encargada de definir las directrices generales, procesos, lineamientos, metodologías y criterios para el funcionamiento del SGR.
 
De acuerdo con lo anterior, la Comisión Rectora del SGR expidió el Acuerdo 045 de 2017, el cual establece en el artículo 4.3.1.2. los proyectos de inversión en los cuales se pueden invertir los recursos del Fondo de Ciencia, Tecnología e Innovación del SGR de conformidad con lo señalado en la Guía Sectorial de Programas y Proyectos de Ciencia, Tecnología e Innovación.