La oficina Asesora de Planeación e Innovación Institucional establece guías de acción, instrucciones o normas generales para tener en cuenta en la formulación y seguimiento de los planes institucionales. Dichos lineamientos están consignados en el manual de planeación institucional y son remitidos a las dependencias como instrumento de apoyo durante las diversas etapas del procedimiento. Los Programas Nacionales de CTeI se encargan de definir y orientar líneas temáticas prioritarias y operativas del Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación.
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