Los Beneficios tributarios son un instrumento eficaz para fomentar la inversión en I+D+i y promover la competitividad en las empresas y el desarrollo de investigaciones de alto impacto para el país.

Este instrumento desarrollado por el Gobierno Nacional, busca ser un incentivo para el desarrollo de proyectos de ciencia, tecnología e innovación (CTeI) por parte de las empresas en alianza con actores reconocidos por el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación otorgando a los inversores y/o ejecutores, deducciones y descuentos tributarios. De igual manera, existen otros instrumentos que buscan fortalecer la infraestructura para la investigación en instituciones de educación y centros de investigación y desarrollo tecnológico reconocidos, a través de la exención del IVA en la importación de equipos y elementos, y fomentar la participación de personal en los proyectos de ciencia, tecnología e innovación a través de los Ingresos No Constitutivos de Renta y/o Ganancia Ocasional.
 
Con el objetivo de calificar y definir los criterios y condiciones para el acceso a los beneficios tributarios, el Gobierno Nacional creó el Consejo Nacional de Beneficios Tributarios, el cual se encuentra integrado por el Ministro de ciencia, tecnología e innovación, quién lo preside, el Ministro de hacienda o crédito público o el director de la Dirección de Impuestos y Aduanas Nacionales –DIAN – o su delegado , el Ministro de Comercio, Industria y Turismo o su delegado, el Ministro de Tecnologías de la Información y las Comunicaciones o su delegado,  el director del Departamento Nacional de Planeación o su delegado, y dos expertos en Ciencia, Tecnología e Innovación. 

Con la Ley 1955 de 2019, se dictaron nuevas disposiciones y crearon los beneficios tributarios de Crédito Fiscal para MiPymes, beneficios tributarios por vinculación de doctores y beneficios tributarios por donación, que entraron a operar en el año 2020.