• Es un Fondo sin personería jurídica creado por la Ley, como mecanismo de administración separada de los recursos que se destinen a la financiación de la Ciencia, la Tecnología y la innovación.

• El Fondo es creado como un Patrimonio Autónomo, en el que COLCIENCIAS es el único Fideicomitente y es administrado a través de un contrato de fiducia mercantil. Sus recursos pasan a ser parte del Patrimonio Autónomo.

• El Fondo no es una persona jurídica independiente, razón por la cual quien tiene la capacidad de contratación con cargo a los recursos que lo integran es la Sociedad Fiduciaria encargada de su administración en virtud del contrato de fiducia mercantil establecido.

• Los Actos y Contratos que celebra el Fondo, se sujetan a las normas de contratación del derecho privado subsidiariamente con la de ciencia y tecnología.

• Los recursos que integran el Fondo solo pueden destinarse a la finalidad prevista en la Ley de su creación. En ningún evento, los recursos del Fondo pueden destinarse a financiar el funcionamiento de COLCIENCIAS, ni de ninguna otra entidad pública.

• En el Fondo se pueden agrupar recursos siempre y cuando compartan la misma finalidad. La CONTRALORÍA GENERAL DE LA REPÚBLICA ejerce el control fiscal de los recursos públicos que se transfieren al Fondo.

• Los recursos del Fondo tienen un seguimiento tanto por fuente como por usos.

• El Fondo puede recibir recursos del Presupuesto General de la Nación que se destinen a la financiación de actividades de Ciencia, Tecnología e Innovación, que se programen para ser ejecutados a través del Fondo.

• Por medio del Fondo se ejecutan proyectos regionales de inversión de ciencia, tecnología e innovación, que beneficien a las entidades regionales con cargo a los recursos del Fondo Nacional de Regalías, incluidos en los planes de desarrollo respectivos.